Unidades de superficie y de la Aviación Naval se empeñan en forma coordinada con los medios de la Prefectura Naval en la tarea de control del mar. Ambas instituciones procuran evitar la pesca ilegal por parte de buques extranjeros.Las misiones de la Escuadrilla de Vigilancia Marítima de la Aviación Naval se realizan tanto en forma diurna como nocturna, control del mar y misiones SAR se encuentran entre las más frecuentes.